Очаговая дезинфекция, в зависимости от того, на каком этапе передачи она производится, делится на заключительную и текущую.
Заключительная дезинфекция проводится в очагах инфекционных заболеваний или смерти больного, реже после выздоровления больного, оставленного на дому. Она проводится однократно и предусматривает полное обеззараживание очага в том случае, когда возбудитель болезни может длительно оставаться жизнеспособным после удаления источника инфекции.
Заключительная дезинфекция проводится также в случае удаления из эпидемического очага инфицированных материалов (трупов погибших животных, животного сырья и т.п.). Проведению заключительной дезинфекции в очаге должно предшествовать эпидемиологическое обследование его. При этом эпидемиолог должен решить, какие предметы в данных конкретных условиях при данной болезни могут быть факторами передачи; являются ли эти предметы потенциально инфицированными.
Заключительная дезинфекция в очагах инфекционных болезней или при подозрении на заболевание чумой, холерой, возвратным тифом , эпидемическим сыпным тифом, болезнью Брилла, лихорадкой Ку (легочная форма), сибирской язвой, высоко контагиозными вирусными геморрагическими лихорадками, брюшным тифом, паратифами, сальмонеллезами, туберкулезом, проказой, орнитозом (пситтакозом), дифтерией, грибковыми болезнями волос, кожи и ногтей (микроспория, трихофития), чесоткой, платяным педикулезом проводится обученным персоналом ЕСЭС.
Заключительная дезинфекция проводится в очагах инфекционных болезней или при подозрении на вирусные гепатиты А и Е, полиомиелит и другие энтеровирусные инфекции, бактериальную дизентерию, ротавирусные инфекции, кишечный иерсиниоз, острые кишечные инфекции, вызванные неустановленными возбудителями. Заявка на заключительную дезинфекцию должна подаваться в Службу ЕСЭС в течение часа после изоляции, госпитализации, смерти больного.
Текущая. Задачей текущей дезинфекции является уничтожение возбудителей инфекции на путях передачи в самом очаге и за его пределами. Текущая дезинфекция в очаге инфекционного заболевания на дому начинает проводиться до госпитализации больного, при лечении на дому, у переболевших до снятия с диспансерного учета. При проведении текущей дезинфекции в очагах инфекционных болезней в основном используют физический метод дезинфекции (кипячение, обработку горячей водой с содой, мылом, моюще-дезинфицирующими средствами, стирку, глажение, проветривание). Химический метод дезинфекции используется для обеззараживания выделений.